宝鸡市妇幼保健院儿童医院建于2010年，是全市医改重点建设项目和卫生事业“十二五”发展规划重点建设项目之一，是一所集儿童医疗、保健、科研、教学、健康教育为一体的三级甲等儿童专科医院，2015年成为全国首批、省内唯一的国家级儿童早期发展示范基地、位列全国前10名，全院占地面积14亩，总建筑面积1.36万平方米，开放床位450张。年门急诊量45万余人次，出院患儿2万多例。
       医院建有现代化的儿科大楼、儿童保健大楼、儿童急诊楼。下设有儿童感染科、儿童消化营养科、儿童免疫内分泌科、儿童呼吸科、儿童神经内科与康复科、儿童急诊重症科、新生儿科、小儿外科、儿童生长发育科、儿童五官科、中医儿科、儿童水疗中心、普通内科、静脉输液配送中心等30个医疗、保健及医技辅助科室。
       医院按照“创专业品牌、建专科医院、育专门人才、拓专项服务”的发展战略，以建设宝鸡市儿童医疗保健中心为目标，先后与美国太平洋医疗中心、加拿大多伦多附属儿童医院、香港广华医院、首都医科大学、上海复旦大学附属儿童医院、上海市妇幼保健中心、武汉市儿童医院等国内外知名单位建立了业务协作关系，每年选派医护人员前往进修学习，并邀请国内外著名专家来院教学查房、示范手术、会诊和讲座，使医院诊疗技术和服务水平与国际保持同步发展。
       新生儿科是国家级重点专科，宝鸡市新生儿疾病诊疗中心，承担国家、省市级新生儿复苏项目的培训任务，负责基层及周边地区高危新生儿转运、救治工作，是西北地区规模最大的新生儿疾病诊疗中心之一，实行无陪护全方位喂养及治疗，在新生儿疑难病症的诊治方面达到了国内先进水平，曾创造了将800克极低体重患儿救治成功和为34+1周早产儿成功双倍换血的记录。
       儿童神经内科与康复科是陕西省残联确定的智障儿童康复基地和全市唯一从事小儿脑病治疗及康复的机构。在小儿脑瘫、脑发育不良、癫痫、儿童孤独症、智力低下等小儿神经系统疾病诊治方面具有独特的疗效。
       小儿外科是宝鸡地区唯一的小儿外科专业科室。科内设有专用手术室，配备德国进口小儿专用麻醉机、小儿腹腔镜等专用设备，在新生儿消化道畸形、先天性巨结肠及腹裂、脐膨出、膈疝等疾病的诊治方面积累了丰富的经验，尤其在血管瘤治疗方面有独特疗效。
       儿科系列为市级重点专科，分为五个独立专科。儿童消化营养科以儿童消化、肾病、过敏性疾病诊疗业务为重点；儿童血液肾病内分泌科着重以血液内分泌、小儿神经性疾病诊疗业务为重点；儿童呼吸科以儿童呼吸疾病诊疗为重点；儿童急诊重症科以儿童哮喘和川崎病为主的免疫性疾病、心肌炎为主的心血管疾病、脑炎等神经系统疾病、营养性疾病、各系统疑难病、遗尿症诊疗为重点；急诊科为全市儿童急救中心，承担全市12县区及周边省市急重症儿童救治任务。
       中医儿科云集全市儿科中、西医知名专家，为儿童提供个性化服务的科室。重点是对早产、低体重、高危儿进行评估、监测和追踪管理。重预防保健，早期发现儿童及青少年各类缺点疾患，及时诊疗，开展儿科特需专家门诊。对儿童疑难病的诊治提供高技术高水平多学科的诊疗，满足不同层次人群的需求。
       宝鸡市妇幼保健院儿童医院的发展建设处处融入了儿童优先的理念，环境优雅，设施设备先进，医疗保健技术精湛，为广大儿童提供高效、优质的全方位、一站式医疗保健服务，已成为全市乃至周边地区儿童健康乐园。